谁先突破上游技术，谁就有机会挑战垄断者的地位，甚至缩短产业链条，重构中下游产业链。
Illumina的发展史，离不开中国基因科技的发展和基因检测公司的贡献，2010年华大基因购买了 128 台 Illumina 测序仪，华大基因成为当时全世界最大的测序服务商，也因此，华大基因成为了 Illumina 最大的客户，占其业务量的 40%。对于卖方 Illumina 来说，现金奶牛诞生了，它立即宣布其配套试剂价格每年将涨价 4%，测序系统直接成为其美国本土销售价格的 2 倍。
甚至，设备制造商拒绝向华大基因提供基本资料，阻挠其向国家监管部门申请基因测序设备注册审批；同时，与华大基因合作的仪器商，还以各种借口拖延并终止已购设备的维修，并将价格本就偏高的临床使用试剂耗材提价近一倍，让华大基因近 1 亿美元的设备险些陷入瘫痪。
这一切的背后，是基因测序产业链条的不平衡。基因检测产业链分为上中下三个环节：上游是测序仪、试剂、耗材，被 Illumina、Thermo Fisher 等少数几个公司垄断，中游提供检测+生物信息分析的测序服务，下游临床、科研等终端用户。市场集中在产业链中下游，已是红海，而真正的行业命脉是上游市场，这块市场被少数几家垄断。
中下游之所以成为红海，是因为上游技术壁垒太高，中游下游公司主要买 Illumina 的仪器，然后给医院提供服务。基因检测技术是由上游驱动的。上游产品对下游服务类企业成本制约和限制很大。「不把握上游的话，上游公司推出一个新的概念可能颠覆整个市场。」田晖博士说。田博士是斯坦福大学的博士，也是安序源的创始人。
也正因为如此，上游享有强势的议价权，甚至让中国最大的基因检测公司华大基因处于劣势地位。面对Illumina的步步紧逼，卸磨杀驴的做法，华大基因自然不甘任洋人宰割，在董事长汪建带领下开始国产测序仪的自强之路。 2013 年 3 月 18 日华大基因宣布以 1.176 亿美元收购上游公司 Complete Genomics。
2015年10月24日，中国深圳--在第十届国际基因组学大会（ICG-10）上，华大基因发布了其自主研发的新型桌面化测序系统BGISEQ-500。该仪器是华大基因继今年6月推出“超级测序仪”―RevolocityTM之后的第二款测序系统。华大基因2013年全资并购Complete Genomics (CG)，经过两年的攻坚，连续发布多款测序系统，展现了其并购整合之后，迅速实现技术转化及再创新，建立起了生命科学领域高端仪器研发和制造的雄厚实力。
BGISEQ-500
BGISEQ-500配备双芯片平台，可适配FCL和FCS两种芯片类型，通过不同设置可实现16种测序模式，数据产出通量在8Gb—200Gb之间自由选择，可满足实验室和临床不同应用情景的测序需求，而无需同时购置低中高三种不同通量测序仪。该发布会还同时展示了个人基因组测序、农业基因组测序、转录组测序等应用的实际测试数据，以及在产前诊断、遗传病检测、肿瘤基因检测等临床应用方面的实例，在准确度和一致性方面均达到甚至超过一线成熟商业测序系统的水平。
2016年11月5日，华大基因在第十一届国际基因组学大会（ICG-11）上发布了其自主研发的高通量台式测序系统BGISEQ-50。这是华大基因继2015年10月24日发布首款桌面型高通量测序系统BGISEQ-500后的又一力作，而BGISEQ-500的订购量已突破500台。
华大基因执行副总裁、华大智造执行总裁牟峰表示，BGISEQ-50的诞生，标志着我国已完全具备了自主可控的核心测序技术和能力，将加速推动以基因科技为支撑的生命数字化建设。
BGISEQ-50是一款更专注、更小巧、更精简的高通量测序平台。该系统沿用了先进的联合探针锚定聚合技术（cPAS）和DNA纳米球（DNB）核心测序技术，采用高精密部件，内置独立的样本加载试剂槽和全自动试剂针穿刺系统，在简约化的结构中自动集成样品加载、测序和分析等多项功能。
BGISEQ-50适用于无创产前筛查、植入前胚胎染色体筛查、染色体异常检测、未知病原体快速检测等临床应用以及RNA表达谱测序等科研领域。以无创产前筛查为例，BGISEQ-50测序系统单次运行可以完成16个样本检测，每台仪器每年可以为超过1万个孕妇提供快速准确的检测服务。
2016年5月27日，华大基因初夏发布会在武汉光谷召开，会上发布了测序应用整体解决方案BGISEQ-500n，这是全球测序技术领域首次大批量列装“中国造”，标志着中国在高端测序技术的源头创新和上下游协同发展的突破及引领。
2017年4月5日，BGISEQ-500测序平台首个人类基因组重测序数据相关文章发表于开放期刊GigaScience。
2018年1月，BGISEQ-500和NIFTY配套试剂盒获得泰国食品药品管理局颁发的进口证书，标志着华大自主研发的BGISEQ-500及用于胎儿染色体非整倍体检测的全套产品可在泰国境内被合法投入市场使用。
但是，几年过去，中国基因测序市场局面并没有被颠覆。中国中下游基因测序公司已成红海。以肿瘤检测为例，根据基因检测龙头公司 Illumina 的测算，在基因检测所有应用中，目前针对人类第一大杀手疾病——肿瘤的基因测序将会占比最高，市场需求最大, 可达百亿市场规模。其中，包括外周血的 ctDNA 检测在内的液体活检将是重要方向。
2016 年、2017 年大概有上千家公司在做这个方向，市场瞬间成为红海。然而很多公司没有自己独到的技术，只有一个概念就成立了一个公司，造成了市场过度拥挤。
这只是一小部分，据《财经》杂志报道，截至 2016 年 9 月，共有 32 家精准医疗公司完成融资，其中 A 轮 20 家、B 轮 11 家、C 轮 1 家；共有 9 家公司得到亿元以上的融资。而在 2017 年大概有上千家公司挤进这个市场，但真正挖到金矿的并不多。
即使有类似华大基因这样的龙头公司的努力，上游壁垒始终未被打破。这既是一个困境，又是一个机会——这意味着，谁先突破上游技术，谁就有机会挑战垄断者的地位，甚至缩短产业链条，重构中下游产业链。
二
即使像illumina这样上游的王者也坐不安稳，因为基因检测的上游还存在一个必须面临的更迭，那就是技术的更新，illumina主打的二代测序，也是目前主要的测序方法，但三代测序、四代测序也在不断发展，做好了代替二代测序的准备，另外还有像基因编辑技术应用于基因检测的创新也是目前流行技术的潜在挑战者。
「我们没有接受他们的收购。原因是他们给出的价格远远低估了 Illumina 的市场份额和自身价值，」Illumina 全球副总兼首席官 Tristan Orpin 在罗氏开价 67 亿美元、第二次对其邀约收购时表示。
罗氏和 Illumina 分别是各自领域的老大，前者占据体外诊断市场的三分之一，后者占据基因测序市场的 70% 以上。
然而间隔仅短短几个月，罗氏再次邀约，价格涨了 15 亿美元。面对罗氏的强势入股，Illumina 管理层最终发动「毒丸计划」，不惜以牺牲自身股价的行为，摊薄对方的股权，使得罗氏最终放弃。
表面上，这是一个大鱼吃小鱼的资本故事。以罗氏集团为龙头的体外诊断目前有数千亿元的全球市场。截止至 2016 年年初，罗氏以 2192.63 亿美元排名全球药企市值第二。而 illunima 的市值仅为罗氏的零头。事实上，两家公司的资本争斗的背后，是行业解决办法之争，是未来趋势之争。
未来诊断和测序将实现融合，融合过程中，诊断和测序谁的路线会最终胜出，谁就有可能领导这场趋势变革。
而技术的迭代对这个行业的排名和市场占有率有着极大的影响，路线的选择本质上就是技术迭代的比拼。
在这场战争里，罗氏扮演着卧薪尝胆的角色——Illumina 曾通过技术将罗氏清出基因检测市场，而罗氏正准备用更新的技术夺回市场主导权。
2007 年，罗氏曾是这个市场的王者。罗氏以 1.55 亿美元现金和股票从 CuraGen 收购了开创二代基因测序技术先河的 454;并在此后的几年里，罗氏凭借 454 成为二代测序市场的领头羊。
而 Illumina 占下了这片江山。原因在于 2013 年，新上市的测序仪如 Illumina 的 MiSeq 等，通过价格的竞争，通过通量的竞争，对 454 技术带来沉重的打击。战争悄然结束，罗氏惨败。2016 年罗氏黯然宣布关闭 454，并裁掉约 100 名员工。
罗氏的撤退并非意味着放弃这个市场，相反，它产生了对这块市场极大的焦虑和欲望。因为它看见了，5-10 年之后，体外诊断市场很可能以基因测序为主，这意味着 5-10 年之后谁能够掌握基因测序的关键技术，谁就有可能变成体外诊断市场的新领导者。
罗氏刚输了一仗，而如果再输下这一仗，那可能就是把龙头老大的位置拱手让给目前测序的老大 Illumina，甚至将被时代永远地抛弃。
外界看来，illunima 是不怕这场战斗的。因为通过过一系列收购、战略合作等手段，Illumina 业务范围早已渗透测序行业上、中、下游，连续多年被 MIT 评为「世界最智慧的公司」。
罗氏并未正面作战，而是在前线修筑战壕——罗氏一直在布局基因测序，并且是更先进一代的技术。因为罗氏知道，这场战役是技术迭代之争，只有通过新一代技术，才能直接与 Illumina 竞争。罗氏以 3 亿 5 千万美元收购第四代基因测序技术公司 Genia。罗氏同时也布局了第三代，包括投资了 Pacific Biosciences 等公司。
第四代技术布局，或将成为罗氏的入场门票——现有的二代技术平台上已经失败了，所有人都在找一个新的突破口，就是往第四代这个技术走，并全力以赴在做第四代。
当前市场上，第二代是领先的，但存在明显的两大约束：一是需要分子扩增，二是使用光学系统检测。先来说分子扩增：由于单个 DNA 分子产生的信号太弱，无法被检测系统识别，需要进行生物放大。在放大的过程中，有的片段更容易被放大，有的较困难，这就产生了不均一性，最后导致有些片段的数量过低，在检测过程中被漏掉，其所携带的信息也就丢失了。分子扩增流程还限制了读长，即有效测序长度。Illumina 二代测序仪的最大读长在 300 个碱基以下。对比一下测序的对象：人类生殖细胞（单倍体）的 DNA 总长 32 亿对碱基；体细胞（二倍体）是生殖细胞 DNA 总量的两倍，分布在 23 对染色体里，即 64 亿对碱基；其中最短的 Y 染色体中 DNA 的长度也达到了 5900 万个碱基。
用 300 个碱基长的片段拼出人类基因组单倍体是个什么概念呢？如果人体 DNA 是一本书的话，需要把这个书撕碎成小碎片，然后再重新拼起来。那么每个碎片有多小？打个简单的比方：当下火爆的畅销小说《权利的游戏》5 部大约 200 万字，相当于将每个字撕成 5 份，再拼成一整部书。可想而之，这是个如何复杂的过程。而越复杂的系统，出错的可能越大，这是二代测序技术的一大短板。
再来说光学检测系统的局限性。光学检测系统已经为大众熟知：照相机、手机镜头都属于光学检测范畴。摄影爱好者都知道，在低光环境下照相难度比较大，所需曝光时间长；这是因为光信号弱，需要通过时间代偿来增加强度。二代测序中的光信号来自荧光标记，其强度相当于夜空里的并不明亮的星星。为了提高检测准确率，除了使用上文提到的分子扩增，还需要用到灵敏的光学器件。如 Illumina 最新推出的 iSeq 就用到了 CMOS 光学传感器。灵敏光学传感器的成本较高，这也是二代测序仪价格较贵的原因之一。为了配合光学检测系统，二代测序的测序流程都包含了循环同步洗脱程序，即每测一个碱基，都需要进行清洗以除去背景光学噪音。以 Illumina 为例，其采用的边合成边测序可逆终止子化学要求每延伸一个核苷酸，就要进行一个循环的荧光检测，裂解荧光基团，洗脱。这是 Illumina 的标志性技术，却也有着不可忽视的缺点：测序时间长。
这两个缺点造成了很多场景没有办法应用，比如走出大型检验中心直接进入基层医院和诊所，以及更广阔的个人消费市场。技术迭代要做的事情就是解决这两个问题。国际市场上主流测序平台由美国 Illumina、Ion Torrent、 Roche 454、 Pacific Biosciences 这四大生产商制造。其中 Ion Torrent（2.5 代）和 Pacific Biosciences（三代）的技术是在 Illumina 上迭代的，但是仍未能撼动其市场地位。
这是因为 2.5 代和三代各有局限。2.5 代的代表是 Ion Torrent，其技术特点是使用离子感应场效应晶体管取代光学传感器，简单来说就是将复杂昂贵大型的超敏「照相机」换成了小型的芯片，用以检测生物信号转换成的电信号。这一变革大大降低了仪器成本，一举占领了中国 50% 的市场。然而，其生物信号的产生依然依赖于焦磷酸测序技术，在精确度上无法与 Illumina 较量，并且没有解决分子扩增步骤带来的读长短等问题。
第三代的突破在于去掉了分子扩增步骤，即所谓的单分子测序。单分子测序在生物学及临床诊断领域具有划时代的意义。分子扩增步骤会引入人为误差，对一些需定量的应用显著不利，如 RNA/cDNA 测序等。单分子测序解决了这一难题；而样品制备步骤的大大简化则满足临床诊断的诉求。然而，其配合单分子测序的检测部件是比二代测序仪更为高精尖的光学仪器，因为失去了分子扩增带来的信号放大，导致成本直线上升。以三代技术的杰出代表 Pacific Biosciences（PacBio）为例，其平均测序成本是 Illumina 的十倍以上。这在价格敏感度高的市场中竞争力不高。因此 PacBio 虽然在生物学上做出了重大突破却只占有全球 3% 的市场份额。
第四代的出现是颠覆性的：不仅能做到单分子长读长测序，还实现了检测部件芯片化从而大大降低成本——第四代技术是单分子测序，核心在于长读长、小型芯片化、适合临床应用市场。这正是测序发展趋势：测序和诊断的融合。
学术和工业界一致认为目前二代测序技术，最可能由第四代测序技术取代。
罗氏看到了这个机会，第四代技术有颠覆 Illumina 的可能。原因在于，测序真正运用到临床诊断，因为精准医疗这个概念基本上也是建立在测试的基础之上，所以要想把精准医疗真正运用到造福人类上的话，就要两者相结合。
但 Illumina 主要垄断的还是研究市场，二代技术的两个局限，读长短和价格高，制约它在临床诊断上的应用。大部分手续相当复杂，整个测序流程非常复杂。
Illumina 要想进一步发展就要走出研究市场的局限性，就必须往诊断市场走。Illumina 自己也在布局第四代，早年投资了第四代公司 Oxford Nanopore。但因为商业化协议纠条款的纷问题，失去了对这公司的控制，这起投资最后成为了财务投资，对 Illumina 的战略布局失效。这个公司在市场上融资非常成功，估值超过了十几亿英镑。从另一个侧面也说明了市场对第四代技术的信心。
田晖博士的团队研究出了第四代的新路径，通过智慧生物芯片解决上游的痛点——从生物信号转化，电信号检测到生信处理，完成基因检测。并且，智慧生物芯片具有高灵敏度、高通量的特点，方便快速检测，小型廉价。这项技术能将整个产业链缩短，打破上中下三游的布局——因为基因检测能直接走进临床诊断。
这是第一家第四代基因测序的中国公司，但不会是唯一一家。这个市场还在以超快的速度增长，根据摩根斯坦利的数据，2014 年基因测序市场规模是 160 亿美金，到 2018 年可能会成长 3 倍，即 460 亿美金。除了肿瘤检测之外，产前预测等多个应用方案将带动整个市场进一步繁荣。唯一需要的就是真正有技术壁垒的团队加入进来。
除了传统的基因检测方法外，近期基于 CRISPR 系统的基因编辑技术也被应用于基因检测，而且很可能颠覆传统的因检测方法，另辟蹊径：
2月15日的《Science》上发表的两项研究分别展示了由 Jennifer Doudna 和张锋实验室基于 CRISPR 系统开发的全新诊断工具。
在其中一篇论文中，Doudna的团队展现了一个名为DETECTR的系统，它可以准确地识别人源样本中不同类型的 HPV 病毒。在另一篇论文中，张锋团队则展示了性能优化的 SHERLOCK 系统，该系统于去年开发成功，用于检测人源样本中的寨卡病毒，登革热病毒以及其他有害细菌。
这两篇论文共同证明了 CRISPR 的巨大潜力，而不仅仅只用于基因组编辑。
“它使新一代诊断技术成为可能，并且比目前的技术更具成本效益” ，罗切斯特大学生物化学和生物物理系的助理教授 Mitchell O'Connell 说。
Doudna 团队：100%准确检测出 HPV 16 感染
在《Science》发表的研究中，Doudna 团队使用的是 CRISPR-Cas12a 系统。他们发现一个很有趣的现象：这种 CRISPR 系统在剪切靶向的双链 DNA 的同时，Cas12 的 DNA 酶活性会被激活，而该酶能非特异性切割单链 DNA（ssDNA）。
该研究的共同作者，加州大学伯克利分校实验室研究员 Janice Chen 对此表示：“这是一个意外但是很‘疯狂’的发现。”
图丨 DETECTR 工作原理
之所以说这是一个“疯狂”的发现，是因为这个发现为细胞内检测是否含有某目的DNA 提供了一个全新的思路：同时向细胞内递送靶向该 DNA 的 CRISPR-Cas12a 系统和非特异性 ssDNA 荧光报告基因（FQ-labeled reporter），一旦检测到目的 DNA，CRISPR-Cas12a 系统将启动，与此同时，荧光报告基因也会被降解，从而释放出荧光信号。
基于此，Chen和她的同事们开发了一种可用于诊断病毒感染的新型诊断工具，并通过与等温核酸扩增技术的联用提高了灵敏度。该工具被命名为DNA Endonuclease Targeted CRISPR Trans Reporter，简称 DETECTR。
到目前为止，科学家们已在试管水平证明 DETECTR 可以100%准确地检测出HPV16感染，92％准确地检测出 HPV18 感染。HPV16 和 HPV18 能增加患者发生癌症的概率，是两种特别危险的HPV 亚型。
“当然，我们还需要不断改进该系统。但从原则上来说，这个想法是可行的，我们真的很兴奋。”Chen说。
令人欣喜的是，相比于其他测试，DETECTR测试价格低廉且快捷：单次成本不到一美元，只需一个小时。
现在，Chen和她的团队正在努力开发能轻松读取荧光信号的硬件设备。他们还想测试系统是否能响应其他人源样本，如血液，唾液或尿液。
张锋团队：灵敏度提高100倍，可检测多种病毒
去年，张锋团队向公众展示了 SHERLOCK 如何利用 CRISPR-Cas13a 在多种人类样本（如唾液）中发现寨卡，登革热的 RNA 序列，甚至一些与癌症突变相关的序列。
而今，SHERLOCKv2 诞生了。与 SHERLOCK 相比，其灵敏度提高了100倍，并能在同一样品中检测出多种病毒感染，比如能同时检出寨卡 和登革热病毒。
之所以能达到这样效果，是因为他们在 SHERLOCKv2 中引入了多种来自不同种属细菌的 Cas13 酶，如 LwaCas13a 和 PsmCas13b。
图丨 CRISPR-Cas13a
这些不同的 Cas 酶对不同的RNA序列表现出不同的“偏爱”程度。换句话说，同时向细胞递送多种酶和多种不同荧光的报告基因，一旦 CRISPR 系统发现目的基因，对应的Cas13就会启动剪切酶活性，剪切相应的荧光报告基因，从而释放出荧光信号。
这原理其实和 Doudna团队的 DETECTR 基本一致，只不过张锋团队设计的荧光报告基因必须是特异性，而 Doudna 团队则是非特异性的。然而，也正是“特异性”这个优点使得 SHERLOCKv2 可以同时检测多种序列。
同样相似的思路是，为了提高灵敏度，张锋团队也引入了等温核扩增技术。但是除此之外，他们向体系中还引入了CRISPR type-III中的Csm6酶。Csm6酶的特异性切割序列为环腺苷酸分子和末端为2’,3’-环磷酸的线性腺苷酸。他们发现通过设计CRISPR系统使得Cas13剪切后的序列是Csm6酶的靶向序列，能大大提高灵敏度。
“这些放入一个管中的所有酶，它们不仅相互作用发挥了更好的作用，而且让我们得到了珍贵的生物学信息。这真是太棒了，充分向我们展现了生物化学的强大力量”，论文的共同作者，来自张锋实验室的博士生 Jonathan Gootenberg说。
目前，病毒感染诊断一般包括病毒分离与鉴定、病毒核酸与抗原的直接检出以及特异性抗体的检测，不仅耗时长，而且对医疗设备和操作人员的专业水准要求很高。因此，如果能开发出一种不需依赖贵重设备和医护人员的智能诊断设备显得非常重要，尤其对于病毒感染经常肆意横行的发展中国家。
而与 DETECTR 相比，张锋团队论文所描述的诊断工具SHERLOCKv2离这样的目标更进一步。
图 | SHERLOCK 试纸检测结果展示
像 DETECTR 一样， SHERLOCK 也使用荧光信号作为输出。但是不仅仅限于此，张锋团队还开发了类似于验孕棒一样的试纸检测方法。现在，不需要任何特殊设备，只需一张试纸，SHERLOCKv2 就能显示出病毒感染检测结果，非常易于使用。
“试想一个很糟糕的情况，没有任何能源如电力。然而只要有样品，SHERLOCKv2 试纸就能在现场发挥作用”，O'Connell 称。而且它也很便宜：SHERLOCKv2 试纸只需几美元。
虽然 DETECTR 和 SHERLOCK 已向我们展现出它们在诊断中的强大力量，但是在进入临床使用前，研究者们仍有很多工作需要做以确保诊断的准确性。
不过，相信这些新诊断工具绝对将改写未来的诊断技术，尤其将给那些缺乏先进设备和训练有素的人员的发展中国家带来很大不同。“它有影响人类健康和全社会的真正潜力”，来自张锋实验室的另一位博士生、该论文的共同作者Omar Abudayyeh说。
总而言之，两支团队正在开发的这些基于CRISPR、用于快速诊断感染的便宜设备，有望为全球，特别是发展中国家的病毒（如 HPV 和寨卡）感染诊断，带来一场真正的革命。
目前illumina要继续努力维持在上游的霸主地位，除了不断发布新产品NovaSeq、iSeq100等进行技术迭代，此前与赛默飞世尔的联手更让业界惊讶，赛默飞授权Illumina销售其优势产品Ion AmpliSeq给Illumina下一代测序平台的科研客户。
“Illumina和赛默飞在全球市场上依旧是头对头的竞争对手，但从理念上来说，哪怕有竞争，我们还是要打造开放平台，能够跟尽量多的伙伴合作。跟赛默飞的合作肯定是双赢，可促进整个基因测序行业的发展。”
同时也把手伸向了中下游，Illumina成立了癌症早筛的血液基因检测公司Grail，与风投公司Telegraph Hill Partners（THP）成立针对法医领域的Verogen。2018年1月4日，Illumina与中国第三医学检验行业领先者金域医学（上交所：603882）共同宣布，双方将利用Illumina的下一代测序（NGS）技术共同为中国患者开发肿瘤及遗传病检测系统，专门用于分子肿瘤及遗传性肿瘤检测。本次合作是符合中国食药监总局（CFDA）审查条件并获取相关批准的重要一步，并将成为以精准医疗造福中国患者的契机。2018年2月Illumina宣布，它已与Harvard Pilgrim医疗保健公司签署了一份基于价值的合同。Harvard Pilgrim是一家非营利性医疗服务公司，为马萨诸塞州、康涅狄格州、新罕布什尔州和缅因州的约120万人提供保险。这项协议的目标是让更多患者能够使用新一代测序（NGS）来进行无创产前检测（NIPT）并获得报销。
基因测序的竞争还延伸到了云计算 基因测序的IT痛点
过去几年，各国都发布了大规模精准医疗计划来检查成千上万人们的基因数据。中国政府2016年公布了为期15年的中国精准医疗计划，过去两年部署了两批约100个精准医疗项目，推动了中国大型测序中心、日益增长的新兴企业以及研究科学家的多领域创新。
不过，市场发展同时，基因检测业务也面临着诸多痛点。
测序公司在业务扩大、样本量不断增长的情况下，需要在生物信息学分析检测报告上得到相应扩展。
首先是数据量爆发增长。“基因测序产生的数据量超过了YouTube视频数据局，基因测序数据以指数级发展。”据赵瑞林提供的数据，目前全球有7万多个BaseSpace注册用户。
具体到基因检测，还面临着耗时、成本、扩展性、可靠性、安全性和协作等问题。
“由于竞争激烈，基因检测公司面临非常大的时间压力，除了在实验过程中尽量压缩时间，生物信息学分析的时间也需优化。但加速又面临着能不能在硬件投入上做得更好。”中源协和基因首席技术官罗玺认为，IT的硬件、人员成本居高不下，现有资源与人员需应对业务动态增长，人为错误或者软件配置改变造成的检测结果偏差，业务数据需要长期安全地保留以及数据需要快速与合作伙伴共享，都是目前需要解决的重点。
基于此，针对数据处理的云计算平台近年来应运而生，云平台可以实现高并发计算，减少人工干预，无需在IT硬件和人员上过度投入，系统可以对应业务增长弹性增加基础资源，并经过授权下载数据，即时分享。
2016年，在深圳举办的第十届国际基因组学大会上，阿里云携手英特尔、华大基因三巨头共同签署战略合作备忘录，宣布启动共建中国乃至亚太地区首个定位精准医疗应用云平台—BGI Online基因数据分析平台。
分析人士认为，这将是国内首个跨越行业边界，由IT企业、基因和生命科学研究机构以及公有云服务提供商合力铸就的精准医疗云平台。
BGI Online是简单高效安全的基因数据分析平台，可以为研究机构，药厂和临床实验室等用户，提供基因组学的数据和应用，满足行业需要。针对用户的不同需求，BGI Online提供公有云和混合云的解决方案，来建立完整用户的生态圈。在此基础上，BGI Online将作为开放科学的平台，提供公共数据和分析应用给所有的用户和开发者。与之对应，BGI Online也会吸引第三方的应用开发者和数据分析服务厂商，将他们的应用整合到公共资源中。
2018年初Illumina也发布了坐标北京的BaseSpace零维度基因云计算平台。
Illumina全球副总裁、大中华区总经理赵瑞林在发布会表示，“Illumina在机器和试剂方面非常领先，但在辅助工具上很多年没有重要进步。BaseSpace在美国用了很多年，但在中国千呼万唤始出来，经历了很多困难。”
BaseSpace是Illumina提供的基因云计算服务，可以提供基因数据的存储、管理和分析，可帮助企业提高测序能力。同时，它提供了一个完整的生态系统，可以分析管理Illumina测序仪产生的数据，支持各种文库，包括刚刚发布的AmpliSeq for Illumina化学试剂。
不同于之前的仪器和试剂销售，BaseSpace是Illumina在中国上线的一项新业务，其最早于2012年在美国上市，历时五年落地中国，“本应在测序仪到中国就落地。”赵瑞林解释，除内部资源调控考虑外，中国特殊的环境，如上云端、寻找合作厂商等也是重要原因。
在上游测序仪领域，目前依旧是illumina雄踞霸主地位，但华大基因除了国产的测序仪进入成熟应用期，在基因大数据领域也具有非同一般的竞争力之外，华大基因拥有一个所有竞争者都不具备的利器——国家基因库。
2011年10月，深圳国家基因库建设方案由国家发展改革委、财政部、工业和信息化部以及国家卫生和计划生育委员会四部委批复，并由深圳华大基因研究院组建及运营。
国家基因库采用基因信息数据库和生物样本资源库相结合的建设模式，以“存、读、懂、写、用”为建设目标，打造既有数据又有可溯源实体样本的新一代基因资源库、信息库、知识库和工具库。旨在保护我国珍贵且特有的遗传资源，实现基因及数据资源共享利用，提高我国基因组数据的储存、分析和管理能力，进而推动生命科学和生物产业发展。
2.23日，发改委又表示，下一步深圳国家基因库要紧紧抓住我国生物经济加快发展的黄金时期，把握生命科学纵深发展、生物技术广泛应用和融合创新的新趋势，以基因技术快速发展为契机，面向国内重大需求，“高标准”加快推进基因库二期建设、“高质量”推进基因库运营管理、“高站位”谋划基因库国际合作，推动基因库成为全球持续领先的生物资源平台。
从现状看，由于基因检测处于快速发展周期中，无论是基础研究、临床应用还是大数据建设，机遇无处不在，变化也无处不在，所以也充满诸多不确定性因素；无论上中下游，都无法高枕无忧，因为前进就意味着变革，变革就意味着风险；但是，风险也意味着巨大的机遇，在生命科技时代来临时，作为解决生老病死最有效的工具，基因检测的应用前景展现出无比巨大的想象空间。当前技术的发展步伐一定程度上制约了市场的规模，而且从基础研究、基因检测到基因治疗整个基因科技的产业链，大多数还处于局部应用和临床试验阶段，没有出现大规模的效益，正处于积累量变转化质变，在变革中孕育的爆发点很可能已经临近。基因科技一旦爆发，就会如同互联网席卷生活的方方面面一样，也会席卷医疗和健康的方方面面。基因检测行业就处于眼前的红海和未来的蓝海之间。
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