厦门大学附属第一医院创办于1937年8月，前身是爱国华侨胡文虎先生捐资成立的“福建省立医院”。从50张床位、87人起步，悬壶济世、救死扶伤至今，医院步履坚实地走过了80余年，现已发展成为一所集医疗、教学、科研、预防及康复为一体的闽西南规模最大的三级甲等综合性医院。医院坐落在美丽鹭岛的鸿山脚下，地处市中心，现有编制床位数2500张。除院本部外，还拥有7家分院（其中马銮湾医院1000张床位在建）、1家互联网医院、2家护理院、6家社区卫生服务中心。现有职工4501人，其中正高448人，副高813人。中高级专业技术人才2900余人，博士304人，硕士868人，博士生导师19人、硕士生导师203人，享受国务院特殊津贴专家21人；特聘国际国内知名专家12人；签约院聘专家9名、双主任8名。获得厦门市高层次卫生人才认定8名、厦门市高层次留学人员9名，福建省卫生健康突出贡献中青年专家2名，厦门市拔尖人才15名，各类人才认定和评审均为全市医疗机构最多。
近10年来医院快速提升发展，跻身福建省高水平三级甲等综合性医院第一梯队，是全国首家“双料”通过HIMSS EMRAM住院、门急诊双7级和国际JCI学术医学中心认证的大型综合性医院。已连续4年跻身“中国医院竞争力·顶级医院百强榜”，位列第86位，是闽西南唯一上榜的医院，实现了厦门市全国顶级医院百强榜零的突破。同时在中国智慧医院HIC 100强排名全国第6，是全省首家“双通过”国家信息化建设标准的医院（国家互联互通标准化成熟度等级“五级乙等”、电子病历系统功能应用水平分级评价“六级级医院”）。医院在2020年顺利通过中国医院竞争力五星级医院认证，并成为全国首家智慧医院HIC 7级的医院
医院是厦门大学的非直属附属医院，是福建医科大学等3所高校的教学医院，同时还承担6所医学院校的教学任务，除学校课堂教学外，目前在院本科生300余人、研究生360余人、规培学员300余人、进修生130余人。设有内、外、妇、儿、急诊、护理等25个临床教研室，临床教师1022人。现有20个国家级住院医师规范化培训基地及1个普外科专科医师规范化培训基地。设有临床教学技能培训中心，含15个功能实训区。医院已连续10年承担福建省住培外科基地结业综合考核考务工作。
厦门市妇幼保健院（厦门大学附属妇女儿童医院）创建于1959年，建筑面积6.3万平方米，是集保健、医疗、教学、科研为一体的大型三级甲等妇幼保健院，承担着为全市妇女、儿童提供保健及医疗服务、指导培训基层妇幼保健工作、统计全市妇幼卫生信息、健康教育、教学、科研等任务。致力于努力降低孕产妇死亡率、婴儿死亡率，促进优生优育，提高出生人口素质，提高妇女儿童健康水平。
医院坚持妇幼卫生工作方针，围绕“一法两纲”的核心任务，开展妇女儿童各期保健，妇女病筛查、诊断、治疗全程化服务及儿科疾病筛查、诊断、治疗全程化服务。积极引进各学科高端人才，努力加强学科建设，打造核心竞争力，形成一批在海峡西岸具有影响力的学科。在2020年中国医院科技量值妇产科学榜单中排名全国第66名，位居福建省第一；在艾力彼中国医院竞争力排行中入选“2020中国医院竞争力·妇幼医院50强 ”榜单。2020年全国三级公立医院绩效考核妇产科专科系列第11名。
医院已通过电子病历系统功能应用水平分级评价五级评审，取得互联互通标准化成熟度测评四级甲等授牌。医院自主研发的信息软件已取得5项计算机软件著作权登记证书。医院先后获得国家卫生计生委（现国家卫健委）进一步改善医疗服务——优质服务示范医院、全国妇幼卫生工作先进单位、全国“三八红旗”集体、福建省卫生计生系统先进集体、福建省省级文明单位、党风廉政建设工作先进单位、福建省“三八红旗”集体等数十项荣誉称号。
复旦大学附属中山医院厦门医院（简称“复旦中山厦门医院”）是复旦大学和厦门市合作建设的重大民生项目，是首批国家区域医疗中心单位。医院位于福建省厦门市五缘湾畔，占地面积6.22公顷，总建筑面积约17.5万平方米，编制床位800张，是一所由复旦大学附属中山医院（简称“复旦中山医院”）按同质化模式全面运营管理的现代化综合性三级医院。
复旦中山厦门医院始终秉承复旦中山医院“以病人为中心”的精神， 倡导 “严谨、求实、团结、奉献、创新、关爱”的核心价值观，传承其严谨的医疗作风、精湛的医疗技术和严格的科学管理等优良传统，计划建成集医疗、教学、科研、预防保健为一体的疑难重症诊疗中心、厦门市多点执业示范基地、保健中心、对台医学交流与合作基地、复旦大学厦门医学科学研究和医学人才培训中心、高等医学院校学生实习与教学基地。
积极鼓励员工参与科研创新，多措并举完善科研平台建设。截至2020年底，医院科研立项共184项，其中国自然科学基金1项；发表论文160余篇，其中SCI论文50余篇；举办各级继续医学教育项目37项，其中国家级项目1项。复旦中山厦门医院招聘和引进的所有住培医师均委托复旦中山医院进行培养，其余工作人员也需要在总部经过一定时限的培训后方能返厦工作。医院建立了住院医师规范化培训体系，成功平移了总部的教学培训师资和能力。
厦门大学附属中山医院（以下简称中山医院）始建于1928年，由爱国华侨和地方知名人士为弘扬中山先生“天下为公，造福社会”的精神捐资兴建而成，时任厦门大学校长、医学专家林文庆博士出任首任院长，1988年随着厦门经济特区发展迁址重建并于7月1日重新开诊，2005年成为厦门大学首家附属医院，现已发展成为拥有4个院区
医院总部占地面积约5.7万平方米，建筑面积约17.1万平方米；金榜分部占地面积约2600平方米，建筑面积约5043平方米；厦禾分部占地面积约1548平方米，建筑面积约2709平方米；在建的东部分院占地面积约9.7万平方米，建筑面积约19.2万平方米。医院现有编制床位3500张（其中1000张在建），拥有教职员工3000余人，其中副高以上专家713名，硕士及博士791名，硕士生导师和博士生导师114名，承担厦门大学医学院的多项临床专业课程教学工作，也是厦门大学博士、硕士研究生培养单位。
近五年，医院获各级课题资助300余项，包括国家“863”和“973”子课题、国家自然科学基金、国家“十一五”科技支撑计划等国家级课题100余项，获省、市各级科技进步奖40余项、国家专利40余项，发表高质量的SCI论文300余篇。2010年-2015年，医院国家自然科学基金立项连续六年全省第一，2017年、2018年连续两年在Nature出版集团发布的自然指数排行榜中名列厦门第一。2018年在中国医院科技量值发布中，医院有6个专科挺进百强榜单，入围专科数量位列厦门第一，2019年中国医院科技量值传染病学专业连续三年排名全国前50，省内排名第一。此外，医院曾连续5年在福建省三级医院评价中名列厦门市综合医院第一；曾连续3年在香港艾力彼关于中国竞争力地市级医院100强排名中，位列厦门市首位、福建省前列，其中2016年排名为全国第15名，消化内科、肾内科、皮肤科等多个学科在2019年最新的艾力彼专业排行榜中名列省、市第一名；在复旦大学管理学院对全国279家医院的科研实力评价中，厦门市只有中山医院入围。2020年中国医院科技量值排行榜中，5个学科全市第一、2个学科进入全国50强；在全国三级公立医院绩效考核中连续两年荣获A+评价。
厦门市中医院创办于1956年，2008年通过三级中医医院评审，2018年通过复评，编制床位1200张、开放床位1250张，现有建筑面积9.6万平方米、二期规划建筑面积7.4万平方米，由总院、南区、禾祥东门诊部组成。同时下辖江头、金山、禾山、殿前4个社区卫生服务中心。近年年均门急诊量（不含社区）200万人次，出院4.5万人次。
2019年国家公立三级中医医院绩效考核等级A级，全国排名66位，福建省排名首位。2020年艾力彼中国中医医院百强排名41位。是国家卫生健康委建立健全现代医院管理制度全国试点、福建省3家名优中医院建设单位之一。2020年成为福建省省级文明单位。
现有职工1905人，医护比0.83，中医类别职业医师（含执业助理医师）占执业医师总数比例52.95%，中级卫生专业技术人员515人、高级卫生专业技术人员402人，博士30人、硕士389人。享受国务院特殊津贴专家5人，全国老中医药专家学术经验继承工作指导老师6人、继承人11人，全国优秀中医临床人才7人，全国中药特色人才5人。福建省省级名中医2人，省级中医优秀临床人才9人，省级老中医药专家学术经验继承工作指导老师8人、继承人18人，省级基层老中医药专家师承带徒指导老师9人、学员5人。厦门市优秀中医临床后备人才38人。国家级学会主任委员1人（中华中医药学会中医外科分会）、国家级学会常委以上23人，省级学会主任委员3人(福建省中西医结合学会肛肠分会、福建省中医药学会儿科分会、福建省中医药学会美容分会），省级学会常委以上23人。建有3个国家级名老中医工作室，2个省级名老中医工作室，6个市级名老中医工作室。建有“国医大师金世元传承工作室”，福建省学术流派传承建设项目“厦门康氏肝病学术流派传承工作室”。通过院士工作指导平台、名医工作室及“双主任制”等柔性引进人才方式，聘任了陈可冀院士、中华中医药学会感染病分会主任委员谷晓红教授、上海交通大学医学院瑞金医院普外科主任彭承宏教授、国家中医药管理局热敏灸重点研究室主任陈日新教授等11位顶级专家。
厦⻔医学院附属第⼆医院（厦⻔市第⼆医院）前身为创办于1898年的⿎浪屿 教会医院，2003年底根据市委市政府统⼀部署迁⾄集美区,承担着辖区及周边100 余万群众的医疗、预防、保健、康复服务以及急重危难患者的诊治、区域内各种突 发事件的紧急医学救治以及落实医改分级诊疗任务等。2015年成功晋级三级甲等 综合性医院，2017年成为厦⻔医学院的直属附属医院，现已成为是厦⻔岛外唯⼀⼀ 所集医疗、教学、科研、急救为⼀体的三级甲等综合性公⽴医院。
医院设有38个临床科室和11个医技辅助科室。医院以“整体推进、重点发展”为 发展思路，以呼吸内科、肾内科、⼼⾎管内科、⼼胸外科、妇科腔镜、肿瘤放射诊 断为重点。其中呼吸介⼊诊疗是呼吸内科的优势，拥有国内⼀流的技术及设备，在 全省⾸先⾏硬质⽀⽓管镜下硅酮⽀架植⼊，并⼴泛开展硬质⽓管镜下的诊断与治 疗，在经软质⽀⽓管镜及硬质⽓管镜下置⼊⽀架等治疗技术⽅⾯达国际先进⽔平， 年呼吸内镜检查/治疗8千余例；肾内科⾎透室是厦⻔市设备最先进、规模最⼤、技 术⼒量最雄厚的⾎液净化室(⾯积近3千平⽅⽶，⾎透机位103个)。
拥有市级医学中⼼1个（厦⻔市呼吸疾病诊治中⼼），6个市级规划重点专科 （妇科腔镜专科、慢性肾病诊疗专科、泌尿结⽯诊疗专科、职业病中毒救治专科、 脑卒中预警综合诊治专科、肿瘤放射诊断专科），2个市级优势亚专科（⽀⽓管镜 和介⼊治疗专业，⾎液透析专业），1个厦⻔市名医⼯作室（陈荣昌名医⼯作 室）。
厦门市仙岳医院位于仙岳路387-399号，依伴着风景秀丽的仙岳山公园，面朝碧波荡漾的筼筜湖，依山傍水。医院始建于1958年，是一所具有61年历史的精神专科医院，现占地面积约5.1万平方米，建筑面积约4.9万平方米，设南北两个院区，以打造园林式医院为特色。2008年8月仙岳医院与南山疗养院合并，正式成为厦门市精神卫生中心，并先后成为厦门医学院非直属附属医院，厦门大学医学院教学医院，闽南师范大学心理学研究生教育创新基地，济宁医学院、福建医科大学、福建中医药大学、福建泉州医高专等高校的实践教学基地，中国厦门—加拿大精神卫生教育与科研合作中心、国家精神心理疾病临床医学研究中心北大六院厦门分中心、国家精神心理疾病临床医学研究中心网络成员单位、国家精神心理疾病临床医学研究中心临床大数据与生物样本库平台建设网络成员单位，宁夏宁安医院共建医院，国家精神科住院医师规范化培训基地等，是全国专科医院中医药工作示范单位、国家药物临床试验机构、福建省精神医学中心建设单位、厦门市“红十字”医院。2010年成为国家“686”项目地区，2014年被推荐成为福建省国家精神卫生综合管理示范区，2017年顺利通过考核。
医院广泛开展国内外学术交流，成立了厦门市精神卫生专家委员会，聘请全国精神专业知名专家学者对医院业务发展进行指导，并不定期邀请专家前来讲座、查房、培训。牵头成立了福建省精神医学专科联盟，集合福建省内外68家（省内59家、省外9家）单位，为福建省内规模和体量最大的精神医学联合体。积极与加拿大、美国、泰国、日本、台湾、香港等国家和地区的精神卫生团队建立友好合作关系，与国际精神专业领域的先进院校合作，组织人员赴美赴加参与研究项目，接受阿尔伯塔大学两位精神科住院医师来我院临床实习，并推动加拿大阿尔伯塔大学与市卫健委合作共建，推动厦门市精神卫生工作向前迈步。举办中美焦虑障碍的认知行为治疗培训班、中美动机访谈学习班、中加精神卫生系列研讨班等多个国家级继续教育培训班。
厦门市第三医院始创于1920年，前身为同安医院，2003年12月正式更名为厦门市第三医院，2006年9月26日，成为福建省中医药大学临床教学医院，2012年5月经省卫生厅、教育厅批准，成为福建省中医药大学第四临床医学院、福建中医药大学附属厦门第三医院，是岛外一所集医疗、教学、科研、预防保健为一体的大型三级综合性医院、国家级爱婴医院、“省级文明医院”、福建医科大学、福建中医药大学临床教学医院、福建省临床住院医师规范化培训基地、国家级住院医师规范化培训基地、于金明院士平台协助医院。
医院也是岛外最早能开展断肢/指再植、脑出血介入治疗、心肌梗死介入治疗的综合性医院，同时又是岛外有高压氧舱治疗紧急中毒能力和有放射治疗设备用于肿瘤放射治疗的综合性医院，岛外较早能独立进行心脏复杂手术的综合性医院。
目前，医院已成为中国卒中联盟综合卒中中心、国家脑防委颅内血肿燥创穿刺清除术协作医院、中国创伤救治联盟创伤救治中心建设单位、国家区域医疗中心神经外科联盟单位、中国肺癌防治联盟肺结节诊治中心、国家心血管病中心高血压专病医联体分中心、国家心血管病中心心力衰竭专病医联体成员单位、国家级胸痛中心建设单位；成为中国糖尿病足联盟福建省首家“糖尿病足防治中心建设单位”、中华足踝医学教育学院在闽首个继续教育培训基地、中国中西医结合学会骨伤科专业委员会足踝专家工作委员会在闽设立的首个足踝外科培训基地。
厦门大学附属心血管病医院（简称“厦心”）成立于2001年9月，是厦门市委、市政府全力打造的优质医疗品牌和厦门市重点民生保障项目，以独有的“厦门速度”实现了从中心到医院的跨越发展，成为福建省唯一的三级心血管病专科医院。2019年6月医院整体搬迁至五缘湾新址，开启医院发展新征程，2021年4月入选委省共建国家心血管病区域医疗中心，成为区域内最具影响力的疑难危重复杂心血管疾病诊疗中心。
医院现址位于厦门市五缘湾医疗园区，建筑面积8.6万平方米，新院设计上全面汲取国际前沿理念，所有的硬件软件均对标国际一流标准，打造一所先进性与人性化兼顾的现代化心血管病专科医院，获评”第三届中国最美医院”。
医院编制床位600张，目前开放床位450张，设心内科5个病区，心外科2个病区，同时设有急诊科、小儿心脏科、CCU、ICU、血管外科病区、结构心脏病区等，心脏康复中心、心血管健康管理中心、检验科、超声科、影像科、心功能科、核医学科、药学部等医技医辅科室齐全。
医院力求技术卓越，在常规开展所有心血管介入诊疗同时，专注复杂冠脉病变、瓣膜病变、心律失常及危急重症患者的救治，并不断开展临床诊疗新技术攻关。心内科开展了欧洲以外地区的首例“心室室壁瘤折叠术”，并成为全球完成最多的中心；在国内率先完成AMEND二尖瓣成型环经心尖途经的植入术；率先在国内开展心室室壁瘤降落伞技术单位之一，共完成26例，为国内开展数量最多、经验最丰富的中心；常规开展各项复杂疑难瓣膜介入手术，在心脏瓣膜病的微创治疗领域积累了丰富全面的手术经验，几乎涉足所有心脏瓣膜的导管治疗，达到国际一流水平。
心外科是福建省腔镜微创手术及A型主动脉夹层手术最多、成功率最高的单位之一，在省内率先开展各类型的分支支架介入治疗和支架开窗介入治疗，在省内率先独立成功开展主动脉夹层、主动脉瘤等大血管疾病保留主动脉瓣的根部替换手术（David手术），是省内唯一一家独立开展微创冠脉搭桥手术和冠脉杂交手术的单位。
陆军第七十三集团军医院是一所集医疗、教学、科研、保健、疗养为一体的三级甲等综合性军队医院。是陆军第七十三集团军医院，安徽医科大学、福建医科大学、第四军医大学、南昌大学医学院临床学院。是厦门市首批城镇职工医疗保险定点医院、福建省首批交通事故救治伤员定点医院、厦门市工伤救治定点医院，是厦门市医保定点单位。
医院展开科室47个，其中临床科室36个，医技辅助科室11个。拥有全军计划生育优生优育技术中心1个，为生殖医学中心；南京军区专科中心5个，分别为脊柱外科中心、肿瘤治疗中心、癫痫诊疗中心、慢性肾病中西医结合诊疗中心、信息技术支持中心；厦门市重大科技平台项目1个，为厦门市生殖医学研究中心；厦门市重点专科1个，为厦门市创伤骨科重点专科；厦门市规划重点专科3个，分别为癫痫诊疗规划重点专科、消化系肿瘤介入治疗规划重点专科、血液净化规划重点专科，肾病中心被确定为厦门市糖尿病健康教育中心。此外，烧伤整形科、泌尿外科、普通外科、胸心外科和老年保健等学科，在本地区具有较大优势。这些中心、重点学科是医院的特色品牌、“拳头”产品，同时通过它们的辐射作用，带动和促进了其他科室发展。
医院拥有教授22名、副教授19名，博导2名、硕导37名。目前设立内、外、妇产、儿科、医技、诊断等6个临床教研室，涵盖所有专业，医院担负安徽医科大学、厦门大学医学院、第四军医大学、南昌大学医学院、福建医科大学等高等医学院校临床教学及军内外进修生的培训带教任务，拥有内科、外科、妇产科、口腔科、病理、麻醉等6个福建省住院医师规范化培训基地。每年到院学习的本科生、研究生、进修生、住院医师规范化培训学员多达200余人次。获各级课题资助130余项，资助金额超1800万元。获得军队科技进步奖100多项，SCI论文40余篇，核心期刊发表论文3000多篇。
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