1.南京军区总医院，1949年4月由解放军接管，1950年命名为华东军区医院，1955年更名为南京军区总医院，1986年更名为南京军区南京总医院。有本部、汤山疗养区、马群东苑、钟岚里、铁心桥、北城圩等6个院区。
2.解放军第81医院，1954年命名，三级甲等综合医院，驻地江苏省南京市。
3.解放军第82医院，1954年命名，1969年移驻淮安，三级甲等综合医院，驻地江苏省淮安市。
4.解放军第83医院，已经撤销番号，缩编划归南京军区南京总医院，现为南京军区南京总医院疗养区及汤山门诊部一部分。
5.解放军第97医院，1954年命名，1978年移防徐州，又称徐州医学院附属淮海医院，驻地江苏省徐州市。
6.解放军第100医院，已经撤销番号编制划归江苏省无锡市解放军第101医院，现为解放军第101医院分院，驻地江苏省苏州市
7.解放军第101医院，又称无锡太湖医院，三级甲等综合医院，驻地江苏省无锡市。
8.解放军第102医院，又称常州和平医院，三级甲等综合医院，驻地江苏常州市。
9.解放军第120医院，1983年改为武警江苏总队医院，驻地江苏省扬州市。
10.解放军第124医院，驻地江苏省南通市，现已撤编。
11.解放军第125医院，已经撤销番号编制划归南京军区南京总医院，现为南京军区南京总医院疗养区及汤山门诊部一部分，驻地江苏南京市。
12.解放军第130医院，已经撤销编制。(数据很难搜寻)
13.解放军第149医院，已经撤销番号，编制划归江苏省淮安市解放军第82医院，现为解放军第82医院149分院，驻地江苏省连云港市。
14.解放军第359医院，1966年组建，驻地江苏镇江市。
15.解放军第414医院，后改称为第二军医大学长征医院分院，驻地江苏南京市。
16.解放军第454医院，后改为南京军区空军医院，驻地江苏南京。
17.解放军第515医院，1976年设立，驻江苏江阴市。
1.南京军区南京总医院与原解放军第81医院(含86临床部)、原第82医院(含149临床部）、原第359医院组建成东部战区总医院。注:86临床部即原解放军第86医院，149临床部即原解放军第149医院。
2.原解放军100医院、原解放军101医院和原解放军102医院三家医院合并组建，以原101医院为本部组建成为解放军联勤保障部队第904医院。
3.解放军第97医院，改称为陆军第71集团军医院。
4.武警江苏省总队医院(原解放军第120医院)。
5.第二军医大学长征医院分院(解放军第414医院)。
6.解放军第454医院，改为东部战区空军医院。
7.解放军515医院暂未找到改制消息。
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